「Naoko」のSilverlightプラグインを開発者版からノーマル版にしてみたが、やはりOperaで表示されない。
「Naomi」なんてSilverlightに加えてWPF（XBAP）まで入ってるのに…。
そこで、「Naomi」のopera:pluginsを参考に、Operaインストールディレクトリのoperaprefs_default.iniに

Plugin Path=C:\Program Files\Microsoft Silverlight\4.0.50524.0

を追加したところ、開発者版でも無事表示されるようになった。
どうやら何らかの理由でSilverlightプラグインのある場所が登録されなくなったらしい。
しかし、「Naoko」以外のマシンもopera:aboutに表示される「プラグインの場所」に上記パスは含まれていないのだが…？

ちなみに、OperaでWPF（XBAP）は実際には表示できない。
パスを登録するとプラグイン一覧に出てくるが、実際にWPF XBAPなサイト（旭山動物園とか）を見ようとするとxpcom.dllがないというエラーが出てくる。
どうやらFirefox専用のプラグインらしく、Operaでは使えないようだ。